Ensüümiklasside nomenklatuur

Allikas: Vikipeedia

Ensüümiklasside nomenklatuur ehk Ensüümide nomenklatuur ehk Ensüümide nimestik on Ensüümikomisjoni poolt koostatud ensüümide nomenklatuur.[1]

Funktsioonid[muuda | muuda lähteteksti]

Ensüümiklasside nomenklatuuri koostamine ja ensüümide ning koensüümide klassifitseerimine, samuti ensüümide sümbolitega seonduv ning ensüümide aktiivsuse ja ensüümikineetika mõõtmise ja kirjeldamise metoodika koostamine.[2][3][4]

Süstemaatika[muuda | muuda lähteteksti]

Ensüümikomisjoni raportite alusel jagatakse ensüümid, soovituslikult, katalüüsitavate reaktsioonide alusel kuude klassi.

Ensüümide klassid[muuda | muuda lähteteksti]

Klassid on ensüümide nomenklatuuris ära toodud numbritega EC. 1 – EC. 6:[5][6]

Ensüümide klassid inimkeha biokeemiliste reaktsioonide kaudu[muuda | muuda lähteteksti]

Klassi number Süstemaatiline nimetus Mõningate alaklasside triviaalnimetused
EC 1. Oksüdoreduktaasid dehüdrogenaasid, oksügenaasid, oksüdaasid, katalaasid, peroksüdaasid, reduktaasid
EC 2. Transferaasid aminotransferaasid, atsüültransferaasid, glükosüültransferaasid, kinaasid
EC 3. Hüdrolaasid desaminaasid, esteraasid, fosfataasid, fosfolipaasid, peptidaasid, ribonukleaasid
EC 4. Lüaasid aldolaasid,dehüdrataasid, dekarboksülaasid, hüdrataasid, süntaasid
EC 5. Isomeraasid epimeraasid,isomeraasid, ratsemaasid
EC 6. Ligaasid karboksülaasid, süntetaasid

Alaklassid[muuda | muuda lähteteksti]

Klassid jagatakse ensüümide nomenklatuuris alaklassidesse, mida tähistatakse numbritega 1-99-ni, näit

  • EC 3.4. näitab ära klassi alaklassi;

Ala-alaklassid[muuda | muuda lähteteksti]

Üksikensüüm[muuda | muuda lähteteksti]

Viimane number ensüümide neljanumbrilises koodis näitab ära üksikensüümi järjekorranumbri ala-alaklassi kuuluvuse alusel, näiteks üksikensüüm

Üksikensüümide loetelu täieneb pidevalt.

Andmebaasid[muuda | muuda lähteteksti]

Ensüümiklasside jaotus ning liikmed ja nende toime ja organismid ning geenid on ära toodud ka erinevates andmebaasides nagu NC-IUBMB, BRENDA[7], EXPASY[8], KEGG[9], Metacyc[10] jpt.[11]

Ajaloolist[muuda | muuda lähteteksti]

  • 1964. aastal anti välja esimene ensüümide soovituslik klassifikatsioon Recommendations (1964) of the International Union of Biochemistry on the Nomenclature and Classification of Enzymes.[12]

Viited[muuda | muuda lähteteksti]

  1. http://mt.legaltext.ee/esterm/concept.asp?conceptID=41940&term=ens%FC%FCmide%20nomenklatuur Vaadatud 06.08.2013)
  2. http://www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme/history.html
  3. Mihkel Zilmer, Ello Karelson,Tiiu Vihalemm, Aune Rehema, Kersti Zilmer. Inimorganismi biomolekulid ja nende meditsiiniliselt olulisemad ülesanded Inimorganismi metabolism, selle häired ja haigused , lk 118, Biokeemia Instituut, Tartu Ülikool 2010, ISBN 978-9985-2-1540-1.
  4. Enzyme nomenclature 1978
  5. Mihkel Zilmer, Ello Karelson,Tiiu Vihalemm, Aune Rehema, Kersti Zilmer. Inimorganismi biomolekulid ja nende meditsiiniliselt olulisemad ülesanded Inimorganismi metabolism, selle häired ja haigused , lk 118, Biokeemia Instituut, Tartu Ülikool 2010, ISBN 978-9985-2-1540-1.
  6. Enzyme nomenclature, 1978. Recommendations (1978) of the Nomenclature Committee of the International Union of Biochemistry, Academic Press, 1979, ISBN 0-12-227160-2. Google`i raamatu osaline veebiversioon (vaadatud (23.05.2013)
  7. http://www.brenda-enzymes.org/index.php4
  8. http://enzyme.expasy.org/
  9. http://www.genome.jp/dbget/
  10. http://www.metacyc.org/cpd-search.shtml
  11. "Meditsiinisõnastik", 2004, Kirjastus Medicina, ISBN 9985-829-55-7
  12. Enzyme nomenclature 1978

Välisallikad[muuda | muuda lähteteksti]