Read

Allikas: Vikipeedia
Jump to navigation Jump to search

Read (inglise keelest) ehk lugem on geneetikas sekveneerimisel kasutatav mõiste. Lugem on ühe maatritssegmendi (nt: DNA,RNA) üks sekveneeritud jupp.

Näiteks juhul, kui maatritssegmendiks on 1000 nukleotiidi pikk cDNA molekuli positiivne ahel ja sekveneerimisel määratakse sellest jupist esimesed 200 nukleotiidi, siis see 200 aluspaari on üks lugem. Paaris otstega readid (inglise keelest "paired end read") on lugemid, mille puhul on teada järjestused selle 1000 aluspaari mõlemast otsast. Tänapäeva sekvenaatorid on võimelised ühe masina jooksutamisega tekitama miljardeid reade.