Keminformaatika
Mine navigeerimisribale
Mine otsikasti
Keminformaatika (tuntud ka kui kemoinformaatika) on füüsikalise keemia haru, mis tegeleb arvutiteaduse võimaldatud tehnikate ja andmevõtumeetodite (nn in silico tehnikad) rakendamisega keemilistes uuringutes, eelkõige uute ravimite väljatöötamisel.[1] Meetodeid saab kasutada ka keemiatööstuses ja sellega seotud tööstusharudes ning sellistes valdkondades nagu keskkonnateadused ja farmakoloogia, kus kasutatakse või uuritakse keemilisi protsesse.[2]
 | Artikli kirjutamine on selles kohas pooleli jäänud. Jätkamine on kõigile lahkesti lubatud. |
Liigendus[muuda | muuda lähteteksti]
Andmebaaside loomine ja haldamine[muuda | muuda lähteteksti]
Tarkvara keemiliste struktuuride andmebaasidega töötamiseks (salvestamine, väljavõtete tegemine):
- ISIS/Host, ISIS/Base (www.mdli.com)
- ChemFinder, ChemOffice (www.cambridgesoft.com)
- JChem (www.chemaxon.com)
- THOR (www.daylight.com)
- MOE (www.chemcomp.com)
- ICM Pro (mySQL) (www.molsoft.com)
- CheD (Сергей Трепалин)
- UNITY (www.tripos.com)
- OrChem (orchem.sourceforge.net)
Keemilist teavet sisaldavad avalikud andmebaasid:
- PubChem (pubchem.ncbi.nlm.nih.gov)
- ZINC (zinc.docking.org)
- DrugBank (www.drugbank.ca)
- BindingDB (www.bindingdb.org)
- DUD (dud.docking.org)
- ChemSpider (www.chemspider.com)
- ChEMBL (www.ebi.ac.uk)
- ChEBI (www.ebi.ac.uk)
Viited[muuda | muuda lähteteksti]
- ↑ "CHEMINFORMATICS | Meaning & Definition for UK English | Lexico.com". Lexico.com (inglise). Originaali arhiivikoopia seisuga 8. juuni 2022. Vaadatud 6. juunil 2022.
- ↑ Thomas Engel (2006). "Basic Overview of Chemoinformatics". J. Chem. Inf. Model. 46 (6): 2267–77. DOI:10.1021/ci600234z. PMID 17125169.
Kirjandus[muuda | muuda lähteteksti]
- Engel, Thomas (2006). "Basic Overview of Chemoinformatics". J. Chem. Inf. Model. 46 (6): 2267–2277. DOI:10.1021/ci600234z. PMID 17125169.
- Martin, Yvonne Connolly (2010). Quantitative Drug Design: A Critical Introduction (2nd ed.). Boca Raton, FL: CRC Press–Taylor & Francis. ISBN 9781420070996.
- Leach, A.R.; Gillet, V.J. (2003). An Introduction to Chemoinformatics. Berlin, DE: Springer. ISBN 1402013477.
- Gasteiger J.; Engel T., toim-d (2004). Chemoinformatics: A Textbook. New York, NY: Wiley. ISBN 3527306811.
- Varnek, A.; Baskin, I. (2011). "Chemoinformatics as a Theoretical Chemistry Discipline". Molecular Informatics. 30 (1): 20–32. DOI:10.1002/minf.201000100. PMID 27467875. S2CID 21604072.
- Bunin, B.A.; Siesel, B.; Morales, G.; Bajorath J. (2006). Chemoinformatics: Theory, Practice, & Products. New York, NY: Springer. ISBN 9781402050008.
Välislingid[muuda | muuda lähteteksti]
Keminformaatika – pildid, videod ja helifailid Wikimedia Commonsis