Keminformaatika
Keminformaatika (tuntud ka kui kemoinformaatika) on füüsikalise keemia haru, mis tegeleb arvutiteaduse võimaldatud tehnikate ja andmevõtumeetodite (nn in silico tehnikad) rakendamisega keemilistes uuringutes, eelkõige uute ravimite väljatöötamisel.[1] Meetodeid saab kasutada ka keemiatööstuses ja sellega seotud tööstusharudes ning sellistes valdkondades nagu keskkonnateadused ja farmakoloogia, kus kasutatakse või uuritakse keemilisi protsesse.[2]
 | Artikli kirjutamine on selles kohas pooleli jäänud. Jätkamine on kõigile lahkesti lubatud. |
Liigendus
[muuda | muuda lähteteksti]Andmebaaside loomine ja haldamine
[muuda | muuda lähteteksti]Tarkvara keemiliste struktuuride andmebaasidega töötamiseks (salvestamine, väljavõtete tegemine):
- ISIS/Host, ISIS/Base (www.mdli.com)
- ChemFinder, ChemOffice (www.cambridgesoft.com)
- JChem (www.chemaxon.com)
- THOR (www.daylight.com)
- MOE (www.chemcomp.com)
- ICM Pro (mySQL) (www.molsoft.com)
- CheD (Сергей Трепалин)
- UNITY (www.tripos.com)
- OrChem (orchem.sourceforge.net)
Keemilist teavet sisaldavad avalikud andmebaasid:
- PubChem (pubchem.ncbi.nlm.nih.gov)
- ZINC (zinc.docking.org)
- DrugBank (www.drugbank.ca)
- BindingDB (www.bindingdb.org)
- DUD (dud.docking.org)
- ChemSpider (www.chemspider.com)
- ChEMBL (www.ebi.ac.uk)
- ChEBI (www.ebi.ac.uk)
Viited
[muuda | muuda lähteteksti]- ↑ "CHEMINFORMATICS | Meaning & Definition for UK English | Lexico.com". Lexico.com (inglise). Originaali arhiivikoopia seisuga 8. juuni 2022. Vaadatud 6. juunil 2022.
- ↑ Thomas Engel (2006). "Basic Overview of Chemoinformatics". J. Chem. Inf. Model. 46 (6): 2267–77. DOI:10.1021/ci600234z. PMID 17125169.
Kirjandus
[muuda | muuda lähteteksti]- Engel, Thomas (2006). "Basic Overview of Chemoinformatics". J. Chem. Inf. Model. 46 (6): 2267–2277. DOI:10.1021/ci600234z. PMID 17125169.
- Martin, Yvonne Connolly (2010). Quantitative Drug Design: A Critical Introduction (2nd ed.). Boca Raton, FL: CRC Press–Taylor & Francis. ISBN 9781420070996.
- Leach, A.R.; Gillet, V.J. (2003). An Introduction to Chemoinformatics. Berlin, DE: Springer. ISBN 1402013477.
- Gasteiger J.; Engel T., toim-d (2004). Chemoinformatics: A Textbook. New York, NY: Wiley. ISBN 3527306811.
- Varnek, A.; Baskin, I. (2011). "Chemoinformatics as a Theoretical Chemistry Discipline". Molecular Informatics. 30 (1): 20–32. DOI:10.1002/minf.201000100. PMID 27467875. S2CID 21604072.
- Bunin, B.A.; Siesel, B.; Morales, G.; Bajorath J. (2006). Chemoinformatics: Theory, Practice, & Products. New York, NY: Springer. ISBN 9781402050008.
Välislingid
[muuda | muuda lähteteksti]
Keminformaatika – pildid, videod ja helifailid Wikimedia Commonsis