Tartu Ülikooli botaanika ja ökoloogia instituut

Botaanika ja ökoloogia instituut oli Tartu Ülikooli bioloogia- ja geograafiateaduskonna instituut.

See loodi aastal 1992. Instituudis oli 4 professuuri – ökofüsioloogia (Kalevi Kull), taimeökoloogia (Martin Zobel), botaanika (Jaanus Paal) ja mükoloogia (Kuulo Kalamees (kõik loodud ühisprofessuuridena TA Zooloogia ja Botaanika Instituudiga). Instituut likvideeriti aastal 2007, mil ta läks Tartu Ülikooli Ökoloogia ja Maateaduste Instituudi koosseisu selle botaanika osakonnana. Õppetoolid seejuures jätkusid.