Kasutaja:Vulkaaniman5625/IRF perekond
Interferooni regulaatorfaktori (inglise keeles interferon regolatory factor, lühend IFR) perekond hõlmab endas transkriptsiooni faktoreid, mis mängivad olulist rolli immuunrakkude diferentsioonis ja aktiveerimises. IRF-e ekspresseerib kogu loomariik, kuid erinevatel loomagruppidel, võib IRF-ide liikmete koosseis olla erinev. IRF perekonna liikmeid tähistatakse sõnalühendiga 'IRF', mille lõppu liidetakse avastamise järjekorra nubmber. Imetajadel on 9 liiget: IRF1, IRF2, IRF3, IRF4, IRF5, IRF6, IRF7, IRF8 ja IRF9 ning lindudel lisaks IRF10. Osa viirused ekspresseerivad IRF-sarnaseid valke.[1]
Domeenid ja nende järjestused[muuda | muuda lähteteksti]
IRF perekonna liikmetel on N-terminaalses ostas DNA-ga seondumise domeen konserveerunud ja see sisaldab kindlasti trüptofaane, mis osalevad DNA-ga seondumises.[1]
Kristallstruktuuri uuringud on näidanud, et DNA-ga seondumispiirkond moodustab heeliks-pööre-heeliks struktuuri. See struktuur tunneb ära konsensus järjestust DNA-l, mis tavaliselt sisaldab vähemalt kaks GAAA kordust (osa uuringud väidavad, et see järjestus on pikem ehk 5'-AANNGAAA-3').[1]
C-terminaalne ots on varieeruvam, kuna erinevatel IRF-i liikmetel täidab see erinevaid ülesandeid. Tavaliselt sisaldab ta NES-i, autoinhibitsiooni, IRF-association domeeni ning signal-responding domeeni, kus on seriini, mido fosfolüülitakse vastuseks patogeenile.[1]
IRF-ide aktiveerimine[muuda | muuda lähteteksti]
Inaktiivses ehk latentses vormis oleval [[IRF3|IRF3]-l on IRF-association domeenil hüdrofoobne pind autoinhibitsiooni domeeniga kaetud. Fosfolüülimine vabastab selle hüdrofoobse pinna ning saab toimuda dimerisatsioon või interaktsioonid teiste kovalkudega. Sama mehhanism on IRF7 ning IRF5 ning seega arvatakse, et selline aktiveerimise mehhanism on kõikidel IRF-idel.[1]
IRF-e aktiveerivad erinevad PRR-id.[1]