APG III süsteem

Allikas: Vikipeedia

APG III (akronüüm ingliskeelsest fraasist Angiosperm Phylogeny Group III system) on kolmas, kõige uuem, peamiselt molekulaar-fülogeneetilisel uuringutel põhinev taimede klassifitseerimissüsteem, mis avalikustati 2009. aastal.

APG III süsteemi loomine[muuda | redigeeri lähteteksti]

Taimede süstematiseerimine liigist ja perekonnast kõrgematesse taksonitesse enne detailsete geneetiliste tõendite kasutusele võtmist, põhines taimede morfoloogial ja biokeemial. Erinevate botaanikute juhtimisel koostati mitmeid süsteeme, millest üks tuntuim, Arthur Cronquisti poolt 1968. aastal loodud ja 1981. aastal avaldatud Cronquisti süsteem, on siiani mitmetes riikides kasutatav. Fülogeneetiliste uuringute valguses ei peeta Cronquisti süsteemi enam taimede fülogeneesi õigesti kajastavaks ning rahvusvahelise süstemaatikute-botaanikute rühma Angiosperm Phylogeny Group (APG), kelle eesmärgiks on luua konsensuslik õistaimede taksonoomia, koostöö tulemusena on avaldatud kolm pidevalt täienevat versiooni katteseemnetaimede fülogeneetilisest klassifitseerimissüsteemist: APG I (1998), APG II (2003) ning APG III (2009)[1].

Seltsid[muuda | redigeeri lähteteksti]

APG III tunnistas kõiki 45 eelmistes süsteemides kasutusel olnud seltsi ning lisas 14 uut. Selts ''Ceratophyllales'' märgiti ekslikult uueks seltsiks, kuigi see oli olemas olnud juba kahes eelmises APG süsteemis. Uued seltsid on: Amborellales, Nymphaeales, Chloranthales, Petrosaviales, Trochodendrales, Buxales, Vitales, Zygophyllales, Picramniales, Huerteales, Berberidopsidales, Escalloniales, Bruniales ja Paracryphiales.

Sugukonnad[muuda | redigeeri lähteteksti]

Uues süsteemis loobuti 2003. aasta versioonis kasutusele võetud nn "sulgudes" sugukondadest. APG III süsteem tunnistab 415 sugukonda. Seda on 42 võrra vähem kui eelmises süsteemis. 55 sulgudes sugukonnast loobuti 44, loobuti veel ka 18 eelmistes süsteemides kasutusel olnud sugukonnast.

Tühistatud "sulgudes" sugukonnad: Illiciaceae, Alliaceae, Agapanthaceae, Agavaceae, Aphyllanthaceae, Hesperocallidaceae, Hyacinthaceae, Laxmanniaceae, Ruscaceae, Themidaceae, Asphodelaceae, Hemerocallidaceae, Kingdoniaceae, Fumariaceae, Pteridophyllaceae, Didymelaceae, Tetracentraceae, Pterostemonaceae, Hypseocharitaceae, Francoaceae, Memecylaceae, Lepuropetalaceae, Rhoipteleaceae, Medusagynaceae, Quiinaceae, Malesherbiaceae, Turneraceae, Bretschneideraceae, Diegodendraceae, Cochlospermaceae, Peganaceae, Tetradiclidaceae, Nyssaceae, Ternstroemiaceae, Pellicieraceae, Aucubaceae, Donatiaceae, Lobeliaceae, Desfontainiaceae, Diervillaceae, Dipsacaceae, Linnaeaceae, Morinaceae ja Valerianaceae.

Tühistati sugukonnad: Limnocharitaceae, Luzuriagaceae, Sparganiaceae, Ledocarpaceae, Heteropyxidaceae, Psiloxylaceae, Oliniaceae, Rhynchocalycaceae, Parnassiaceae, Maesaceae, Myrsinaceae, Theophrastaceae, Eremosynaceae, Polyosmaceae, Tribelaceae, Aralidiaceae, Mackinlayaceae ja Melanophyllaceae.

Kasutusele võeti 20 uut sugukonda ning mõned sugukonnad liigitati ümber. Uued sugukonnad on: Petermanniaceae, Schoepfiaceae, Limeaceae, Lophiocarpaceae, Montiaceae, Talinaceae, Anacampserotaceae, Centroplacaceae, Calophyllaceae, Guamatelaceae, Gerrardinaceae, Dipentodontaceae, Capparidaceae, Cleomaceae, Cytinaceae, Mitrastemonaceae, Metteniusaceae, Linderniaceae, Thomandersiaceae ja Quintiniaceae.

Seltsivälised sugukonnad[muuda | redigeeri lähteteksti]

Seltsidesse mitte liigitatud sugukondade arv kahanes kolmekümne üheksalt kümneni. Apodanthaceae ja Cynomoriaceae paigutati katteseemnetaimede hulka incertae sedis. Veel kaheksa sugukonda paigutati incertae sedis erinevatesse katteseemnetaimede alamtaksonitesse.

Nendeks sugukondadeks on: Apodanthaceae, Cynomoriaceae, Dasypogonaceae, Sabiaceae, Dilleniaceae, Icacinaceae, Metteniusaceae, Oncothecaceae, Vahliaceae ja Boraginaceae.

Lahtiseks jäi sugukonna Icacinaceae taksonoomia. Apodytes, Emmotum, Cassinopsis ja veel mõned perekonnad loetakse sugukonda kuuluvaks seni, kuni uurimused seda kas kinnitavad või ümber lükkavad.

Perekonnad[muuda | redigeeri lähteteksti]

Kolm perekonda (Gumillea, Nicobariodendron ja Petenaea) paigutati katteseemnetaimede hulka incertae sedis. APG II süsteemis oli Gumillea taksonoomia määratlemata. Nicobariodendron ja Petenaea lisati alles nüüd. Viimane liigitati eraldi sugukonda Petenaeaceae seltsis Huerteales[2][3]

Allpool on ära toodud klassifikatsiooni kaks versiooni. Lühem versioon näitab sugukond-selts taset ning sugukondi, mis ei kuulu ühtegi seltsi. Samal tasemel asuvad sugukonnad on tähestikulises järjekorras. Tasuks tähele panna, et seltsi ei pruugi enam kuuluda samad sugukonnad, mis varasemates APG süsteemides.

Detailsema ülevaate taksonoomiast annab fülogeneetiline puu.

APG III süsteemi lühiversioon[muuda | redigeeri lähteteksti]

Detailsem versioon (koos sugukondadega)[muuda | redigeeri lähteteksti]

Legend:

* = sugukonna paigutus on muutunud;
= uus selts APG süsteemis;
§ = sugukonna piirid kirjeldatud tekstis ;
$ = sugukonnad laiemas mõistes kui APG II süsteemis ;
$$ = sugukonnad, mis olid APG II süsteemis "sulgudes", siin eelistatud kitsamas mõistes

Angiospermae[muuda | redigeeri lähteteksti]

Magnoliidae[muuda | redigeeri lähteteksti]

Monocotyledoneae[muuda | redigeeri lähteteksti]

Kommeliniidid[muuda | redigeeri lähteteksti]

Tõenäoline Dicotyledoneae sõsarselts[muuda | redigeeri lähteteksti]

Dicotyledoneae[muuda | redigeeri lähteteksti]

Päriskaheidulehelised[muuda | redigeeri lähteteksti]

Rosiidid[muuda | redigeeri lähteteksti]

Pärisrosiidid I[muuda | redigeeri lähteteksti]

Pärisrosiidid II[muuda | redigeeri lähteteksti]

Asteriidid[muuda | redigeeri lähteteksti]

Pärisasteriidid I[muuda | redigeeri lähteteksti]

Pärisasteriidid II[muuda | redigeeri lähteteksti]

Määratlemata positsiooniga taksonid[muuda | redigeeri lähteteksti]

Fülogeneetiline puu[muuda | redigeeri lähteteksti]

APG III süsteem põhines fülogeneetilisel puul, kuhu kuulusid kõik õistaimede 59 selti ja 4 määratlemata asukohaga sugukonda. Kuue ülejäänud sugukonna asetus süsteemis ei olnud võimalik kindlaks määrata ning nad on kirjas liigitustabelis "Detailne versioon".

Allpool toodud fülogeneetiline puu avaldati koos APG III süsteemiga, kuid ilma mõningate vahepealkirjadeta.

angiospermid 

Amborellales




Nymphaeales




Austrobaileyales


mesangiospermid 


Chloranthales


magnoliidid 


Canellales



Piperales





Magnoliales



Laurales






monocots 

Acorales




Alismatales




Petrosaviales





Dioscoreales



Pandanales





Liliales




Asparagales


commelinids 

Dasypogonaceae



Arecales



Poales




Commelinales



Zingiberales












Ceratophyllales


eudicots 

Ranunculales




Sabiaceae



Proteales




Trochodendrales



Buxales


core eudicots 

Gunnerales




Dilleniaceae




Saxifragales


rosiidid 

Vitales


pärisrosiidid 
fabiidid 

Zygophyllales





Celastrales




Oxalidales



Malpighiales






Fabales




Rosales




Fagales



Cucurbitales







malviidid 


Geraniales



Myrtales





Crossosomatales




Picramniales




Sapindales




Huerteales




Brassicales













Berberidopsidales




Santalales




Caryophyllales


asteriidid 

Cornales




Ericales


pärisasteriidid 
lamiidid 

Garryales




Boraginaceae



Gentianales




Solanales



Lamiales






kampanuliidid*




















Kampanuliidid (jätkub)[muuda | redigeeri lähteteksti]

*campanulids 

Aquifoliales




Asterales



Escalloniales




Bruniales




Apiales




Paracryphiales



Dipsacales








Välja arvatud sugukondi asendavad alamsugukonnad[muuda | redigeeri lähteteksti]

APG II süsteemis sulgudesse pandud ning APG III süsteemist välja arvatud sugukondade asemele on pakutud mitmeid alamsugukondi.[4] Need on ära toodud järgnevas tabelis.

Alamperekonnad APG II sulgudes sugukondade asemel
APG II bracketed sugukond APG III sugukond: subsugukond
Agapanthaceae Amaryllidaceae: Agapanthoideae
Agavaceae Asparagaceae: Agavoideae
Alliaceae Amaryllidaceae: Allioideae
Amaryllidaceae Amaryllidaceae: Amaryllidoideae
Aphyllanthaceae Asparagaceae: Aphyllanthoideae
Asparagaceae Asparagaceae: Asparagoideae
Asphodelaceae Xanthorrhoeaceae: Asphodeloideae
Hemerocallidaceae Xanthorrhoeaceae: Hemerocallidoideae
Hesperocallidaceae Asparagaceae: Agavoideae
Hyacinthaceae Asparagaceae: Scilloideae
Laxmanniaceae Asparagaceae: Lomandroideae
Ruscaceae Asparagaceae: Nolinoideae
Themidaceae Asparagaceae: Brodiaeoideae
Xanthorrhoeaceae Xanthorrhoeaceae: Xanthorrhoeoideae

Vaata ka[muuda | redigeeri lähteteksti]

Viited[muuda | redigeeri lähteteksti]

  1. K.Kolsar, Katteseemnetaimede sekveneerimisprojektid ja genoomiduplikatsioonid taimede evolutsioonis, TARTU ÜLIKOOL LOODUS- JA TEHNOLOOGIATEADUSKOND MOLEKULAAR- JA RAKUBIOLOOGIA INSTITUUT BIOINFORMAATIKA ÕPPETOOL, Tartu 2011
  2. Christenhusz, M. J. M., M. F. Fay, J. J. Clarkson, P. Gasson, J. Morales Can, J. B. Jimenez Barrios & M. W. Chase (2010). Petenaeaceae, a new angiosperm sugukond in Huerteales with a distant relationship to Gerrardina (Gerrardinaceae), Botanical Journal of the Linnean Society 164: 16-25. http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/j.1095-8339.2010.01074.x/abstract
  3. Christenhusz, M. J. M., M. W. Chase, & M.F.Fay (2011). Preface to "Linear sequence, classification, synonymy, and bibliography of vascular plants: Lycophytes, ferns, gymnosperms and Angiospermae", Phytotaxa 19: 4–6. http://www.mapress.com/phytotaxa/content/2011/f/pt00019p006.pdf
  4. A subfamilial classification for the expanded asparagalean families Amaryllidaceae, Asparagaceae and Xanthorrhoeaceae, doi:10.1111/j.1095-8339.2009.00999.x 

Välislingid[muuda | redigeeri lähteteksti]